תשובה:
ההפרדה בין חלבונים מבוססת על המשקל המולקולרי שלהם.
הסבר:
SDS-PAGE הוא ההפרדה של חלבונים, בתחום חשמלי, על בסיס המשקל המולקולרי שלהם.
החלבונים הם denatured על ידי חימום בין 70 ל 100 מעלות צלזיוס בנוכחות תרכובות כגון 2-mercaptoethanol או dithiothreitol, ו- SDS (sodium dodecyl sulphate). את mercaptoethanol או dithiothreitol ישבור את האג"ח disulphide בחלבון ולגרום לו להתפתח ולהיות ליניארי (כמו מחרוזת ארוכה ללא קפלים). ה- SDS יעזור להתפתח תהליך וגם לכסות את החלבון מטען שלילי.
תערובת מוחל מכן על ג'ל polyacrylamide (סיביות PAGE ב SDS-PAGE) ו זרם חשמלי מוחל. החלבונים טעונים שלילי יעברו בשדה חשמלי. הדף ימנע חלבונים גדולים יותר לנוע מהר מאוד לעומת חלבונים קטנים (PAGE פועל כמו מסננת). התוצאה תהיה שהחלבונים הגדולים יישארו קרובים לתחילת הג'ל, ואילו החלבונים הקטנים ימשיכו הלאה אל תוך הדף.
תוכל לראות את SDS-PAGE בפעולה בסרטון הבא:
מהו תפקידם של ערוצי חלבונים בקרום התא?
ערוצי חלבונים מאפשרים למולקולות גדולות או קוטביות לעבור דרך קרום התא החדיר באופן סלקטיבי באמצעות דיפוזיה נוחה. ה bilayer phospholipid, המוצג להלן, המרכיבה את קרום התא הוא חדיר חלקית. משמעות הדבר היא שהיא מונעת באופן סלקטיבי מולקולות קוטביות גדולות ויונים מסוימים לעבור לתא או לצאת ממנו. חלבונים התחבורה משמשים ולכן להעביר אותם, למעשה על ידי עובר את הממברנה. ישנם שני סוגים של חלבונים התחבורה: המוביל והערוץ. חלבונים הערוץ הם נקבוביות מלאות מים המאפשרים חומרים טעונים (כמו יונים) כדי לפזר דרך הממברנה לתוך התא או החוצה. במהותם, הם מספקים מנהרה עבור מולקולות קוטביות כאלה לעבור את הקוטב הלא קוטבי או הידרופובי של bilayer. המולקולה נ
מה מונומרים הם חלבונים עשוי? מהו המבנה של המונומר שמרכיב חלבון?
חלבונים יש חומצות אמינו כמו מונומרים חלבונים מורכבים של 21 L- חומצות אמינו שונים. חומצות אמינו אלה מתחברות יחד עם אג"ח פפטידים. הקשר פפטיד הוא קשר בין קבוצה caboxylic של חומצת אמינו אחת עם קבוצת אמינו של חומצת אמינו אחרת. להלן דמות המתארת את המבנה של חומצת אמינו אחת, כאשר R-group משתנה וניתן לתרום לחומצת האמינו להיות ניטרלית, חומצית או בסיסית. הדמות הבאה נותנת מושג על כמה חומצות אמינו שונות קיימות. חומצות אמינו שונות כולם מוזמנים לכל הצעה לעדכון התשובה Cheerio!
למה דטרגנטים נדרש לחלץ חלבונים ממברנה אינטגרלי, אבל לא חלבונים קרום הפריפריאלית?
חלבונים חיצוניים או פריפריאליים מוחזקים בחופשיות בקרום, הסרתם קלה. הם יכולים להיות מוסר פשוט על ידי שינוי ה- pH. חלבונים פנימיים מוטמעים עמוק בתוך הממברנה, ולכן עבור שלהם isloation דטרגנטים נחוצים.